Устюртский

Рельеф: Территория заповедника включает фрагменты двух геоморфологических районов: в западной части – впадины Карынжарык, в восточной – Западного Устюрта. В рассматриваемых границах рельеф плато характеризуется как волнистая и волнисто-увалистая равнина за счёт чередующихся невысоких увалов, слабоволнистых поверхностей ложбин и впадин. Широко развиты различные формы мезо- и микрорельефа в виде сухих долин, такырных понижений, воронковидных суффозионных западин и блюдец, создающих комплексность почв. Абсолютные отметки колеблются от 100-120 м до 180-300 м, максимальная высота 341 м (р-н кол. Кугусем), наибольшая на всем западном чинке.Впадина Карынжарык – крупный прогиб, сложенный плащом сильно- засолённых песчано-глинистых отложений Каспийских трансгрессий. Древняя и современная эоловая переработка морских отложений привела к формированию на поверхности прогиба неширокого массива бугристо-грядовых песков, вытянувшегося с севера на юг более чем на 100 км и соровых понижений. Самое крупное из них Кендирли сор (-70). Амплитуда колебаний между верхними и нижними отметками неоднозначна. В полубугристых песках 1-3 м, в бугристо-грядовых до 10-15 м. В северной части впадины Карынжарык выделяется своеобразное антиклинальное поднятие – гора Карамая, высотой более 100 м и длиной около 15 км.

Геологическое строение: Территория заповедника представлена разнообразными ландшафтами: чинки, плато, бессточные впадины, пески. Границы плато Устюрт в виде высоких (150-300 м), сильно расчленённых обрывов (чинков) с выходом коренных пород. Плато Устюрт-причинковая зона-равнина более расчленённая на юге, имеющая вполне спокойные очертания на севере. Солончак Кендирли бессточная впадина относится к серовому типу, является, по всей видимости результатом эрозионной деятельности Каспийского моря. Массив Карынжарык слагают в основном грядово-бугристые и равнинные пески, закреплённые и полузакреплённые растительностью с островными участками подвижных барханов, почти лишённых растительного покрова.

Климат: Континентальный сухой климат. Лето жаркое и продолжительное, со средней температурой июля +26, +28°С, с максимумом до +60°С. Средняя температура января -2,5, -5°С. Минимальные температуры падают до - 45°С по понижениям рельефа. Нередки метели, гололед и оттепели - до 45 дней за зиму. Снежный покров неустойчив и формируется лишь в 50% зим. Среднегодовое количество осадков не превышает 120 мм с максимумом в осенне-зимний период.

Водный режим: Район заповедника отличается слабой обводненностью. Основными источниками являются родники и колодцы. В центральной части территории расположен Кендирли сор, занимающий 56,8 тыс. га. Здесь в осенне-зимний период скапливается большое количество дождевых, талых вод образуя временное озеро, высыхающее к началу лета.
1) УНЕРЕ – самый крупный родник заповедника, расположенный вблизи южной границы в предчинковой зоне. В 60-70 годах геологоразведчиками сооружена плотина, способствующая поднятию уровня воды. Длина русла около 6-7 км. Вода слабо солённая.
2) ТУНДЫ – 5 км к северу от колодца Кансу в средней части чинка, мелкий, без водосборов. Вода слабо солённая.
3) БЕЗЫМЯННЫЙ РОДНИК №1 – в 7-8 км к северу от р.Тунды, у подножия верхней террасы чинка, мелкий, без водосборов.
4) САРЫБУЛАК – в 3 км от безымянного родника №1 к северу у подножия второй террасы чинка. Слабый водоток около 50 м.
5) Вторым по величине является КЕНДИРЛИ – в центральной части заповедника, в урочище Кендирли. 5 родников, 4 из них с постоянными водотоками.
6) ЖАМАН КЕНДИРЛИ – в 5 км северо-западнее от родников Кендирли, из четырёх имеющихся родников с постоянными водотоками – 2. По руслам вода течёт только во влажные сезоны года, остальное время водоток прерывается, но не высыхает.
7) КУГУСЕМ – в 3 км юго-западнее кол. Кугусем, под чинком в основании каньонообразного ущелья, вода собирается в углублении, стекая со стен ниш. Это единственный пресный родник.
8) КАРАМАЯ – мелкие 5-6 родников (соленные). Во влажные сезоны года стабильность водотоков сохраняется.
9) БЕЗЫМЯННЫЕ родники – в центральной и западной части Карамая у подножия чинка в 1 км друг от друга и имеют по нескольку водотоков.
10) Скважина ТАСУТКЕЛЬ – находится у западной кромки Кендирли сора, в основании грейдера через сор. Водоток слабый. Вода тёплая, с запахом сероводорода и большим содержанием железа.
11) Скважина АКШУЙМАК – в 13 км к юго-западу от Кадырберди. Слабый водоток сохраняется постоянно.
12) Родник ЖАРЫК – в 20 км южнее скважины Тасуткель у западной кромки Кендирли сора, мелкие 3 источника без водотоков.
13) БЕЗЫМЯННАЯ скважина №1 – примерно в 10 км к югу от родника Жарык, водоток слабый. Непосредственно на территории и вблизи границы заповедника имеется примерно около двух десятков колодцев.

Почвенный покров: На причинковой полосе Устюрта почвы серо-бурые солонцеватые, с прослоями гипса, с трещиноватой такыровидной твердой поверхностью. Бугристо-грядовые пески закреплены или полузакреплены псаммофитами и саксаулом, но почвенного покрова не имеют. Поверхность Кецдерлисора, сформированная в условиях близкого залегания грунтовых вод, представляет собой соленые илистые грязи с постоянно топкой поверхностью. Днища вогнутых депрессий служат местом накопления большого количества хлоридов и сульфитов мощностью до 10 м.